Akut lenfoblastik lösemi hastalarında t(12;21) TEL-AML1 translokasyonunun gerçek zamanlı qRT-PZR ile 5 yıllık sonuçlarının değerlendirilmesi

Nur Selvi Günel; Burçin Tezcanlı Kaymaz; Vildan Bozok Çetintaş; Aslı Tetik Vardarlı; Sunde Yılmaz Süslüer; Duygu Aygüneş; Ayegül Dalmizrak; Çağdaş Aktan; Ali Şahin Küçükaslan; Tuğçe Balcı; Çağla Kayabaşı; Besra Özmen Yelken; Çığır Biray Avcı; Buket Kosova; Zuhal Eroğlu; Serap Aksoylar; Nazan Çetingül; Can Balkan; Deniz Yılmaz; Yeşim Aydınok; Kaan Kavaklı; Mahmut Töbü; Murat Tombuloğlu; Filiz Büyükkeçeci; Fahri Şahin; Güray Saydam; Cumhur Gündüz

doi:10.5606/fng.btd.2016.033

Nur Selvi Günel¹, Burçin Tezcanlı Kaymaz¹, Vildan Bozok Çetintaş¹, Aslı Tetik Vardarlı¹, Sunde Yılmaz Süslüer¹, Duygu Aygüneş¹, Ayegül Dalmizrak¹, Çağdaş Aktan¹, Ali Şahin Küçükaslan¹, Tuğçe Balcı¹, Çağla Kayabaşı¹, Besra Özmen Yelken¹, Çığır Biray Avcı¹, Buket Kosova¹, Zuhal Eroğlu¹, Serap Aksoylar², Nazan Çetingül², Can Balkan³, Deniz Yılmaz³, Yeşim Aydınok³, Kaan Kavaklı³, Mahmut Töbü⁴, Murat Tombuloğlu⁴, Filiz Büyükkeçeci⁴, Fahri Şahin⁴, Güray Saydam⁴, Cumhur Gündüz¹

¹Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, İzmir, Türkiye
²Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi, Çocuk Onkoloji Bilim Dalı, İzmir, Türkiye
³Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi, Çocuk Hematoloji Bilim Dalı, İzmir, Türkiye
⁴Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi, Hematoloji Bilim Dalı, İzmir, Türkiye

Anahtar Kelimeler: Akut lenfoblastik lösemi; polimeraz zincir reaksiyonu; revers transkriptaz.

Özet

Amaç: Bu çalışmada akut lenfoblastik lösemi (ALL) ön tanılı olgularda t(12;21) translokasyonu gerçek zamanlı kantitatif revers transkriptaz polimeraz zincir reaksiyonu (qRT-PZR) yöntemi kullanılarak kantite edildi.
Hastalar ve yöntemler: Ocak 2009 - Aralık 2013 tarihleri arasında Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı’na başvuran 175 pediatrik ve 138 erişkin olmak üzere toplam 313 olguya ait kan ve kemik iliği örneklerinde t(12;22) (p13;q22) translokasyonu RNA sonuçları kantitatif olarak değerlendirildi. Olgulara ait 75 kan ve 484 kemik iliği örneklerinden total RNA veya haberci RNA izole edildi. RNA izolasyonlarının ardından tamamlayıcı DNA sentezi gerçekleştirildi. t(12;21) (p13;q22) translokasyon çalışması LightCycler t(12;21) Kit’i ile füzyon transkripte özgül biçimde tasarlanmış primer ve problarla (Way2Gene) uygun olacak şekilde gerçekleştirildi. Son adım olarak, t(12;21) translokasyon sonuçlarının kantitatif olarak değerlendirilmesi gerçek zamanlı qRT-PZR yöntemi kullanılarak LightCycler2 ile gerçekleştirildi.
Bulgular: Otuz dört pediatrik olgu örneğinde (%19) ve 17 erişkin olgunun örneğinde (%12) TEL-AML-1 (ETV6-RUNX1) pozitif bulundu. TEL-AML1 (ETV6-RUNX1) kantitasyon değeri ortalaması pediatrik olgularda 0.90±3.21, erişkin olgularda ise 0.34±1.20 olarak belirlendi.
Sonuç: Elde ettiğimiz veriler, gerçek zamanlı qRT-PZR yöntemi ile ALL hastalarında yeni tanı döneminde ve tedavi sürecinde t(12;21) translokasyonunun kantitatif tayininin hem tanının kesinleştirilmesinde hem de moleküler remisyon sağlanmasına yönelik tedaviyi yönlendirmesinde değerli bir yöntem olduğunu desteklemektedir.